Laboratórios Isomórficos mostrado IsoDDEuma plataforma de design de medicamentos assistida por inteligência artificial que representa um salto desde AlfaFold 3o modelo de referência anterior para prever a estrutura biomolecular.
De acordo com a equipe técnica da empresa e relatórios publicados, IsoDDE permite agendamento de medicamentos com precisão e velocidade sem precedenteso que poderia revolucionar o desenvolvimento de novos tratamentos.
AlfaFold 3criado por Google DeepMind e lançado em 2024, revolucionou a previsão da estrutura e dos complexos moleculares das proteínas. O seu impacto é global: tem sido utilizado em investigação em mais de 190 países e permitiu identificar as interações necessárias na investigação de medicamentos. No entanto, de acordo com o Isommorphic Labs, a sua capacidade de mapear novas regiões do espaço molecular, ou seja, novas moléculas não encontradas nos dados de treino, limitou a sua utilidade no design de medicamentos no mundo real.
Foi essa limitação que levou à criação IsoDDEdesenvolvido pela filial de Alfabeto Inc. “Abrimos um novo paradigma de precisão preditiva na compreensão do mundo biomolecular”, afirma o white paper da empresa. IsoDDE introduz uma nova arquitetura e protocolo de treinamento que permite prever estruturas e interações mesmo em sistemas biológicos indefinidos ou com compostos distantes dos exemplos anteriores.
Entre seus principais desenvolvimentos, O IsoDDE pode prever estruturas proteína-ligante e proteína-proteína com alta precisão, mesmo em casos complexos que estão fora do escopo das ferramentas anteriores..
O teste comparativo, coletado no relatório técnico da Isommorphic Labs, mostra isso IsoDDE dobra a taxa de dano do AlphaFold 3 para prever estruturas de ligantes de proteínas nos desafios mais difíceis, como a tag Runs N’ Poses. IsoDDE atinge 50% de eficiência em um sistema completamente novo para o modelouma melhoria de mais de 26 por cento em relação ao AlphaFold 3.
A área também aborda um dos maiores desafios da química computacional: a previsão quantitativa das interações de ligação entre moléculas.
A equipe do Isommorphic Labs destaca isso O IsoDDE prevê as interações de ligação de pequenas moléculas com uma precisão que excede os métodos físicos tradicionais, como o FEP, e o faz em uma fração do tempo e do custo.. Isto permite um melhor controle e otimização de compostos e reduz a dependência de testes caros em programas de descoberta de medicamentos.
O IsoDDE também proporciona melhorias significativas para o projeto de terapias biológicas complexas, particularmente na previsão de interações anticorpo-antígeno e na modelagem da alça CDR-H3, a região mais variável dos anticorpos.
Os dados coletados pela Isommorphic Labs mostram isso O IsoDDE aumenta a taxa de previsão correta das interações anticorpo-antígeno em 2,3 em comparação com AlphaFold 3 e em até 19,8 em comparação com o modelo Boltz-2.expandindo assim a gama de possíveis terapias baseadas em anticorpos.
Um exemplo notável é o caso dos receptores cerebelochave para marcar as proteínas erradas e eliminá-las. Há mais de 15 anos que se assume a existência de um único sítio de ligação modular.
No entanto, pesquisas experimentais recentes descobriram outro local, mais complexo e difícil de identificar. Usando apenas a sequência de aminoácidos, O IsoDDE previu corretamente a localização do sítio tradicional e do novo sítio misterioso, sem informação prévia do ligante, reproduzindo os resultados experimentais..
O relatório técnico destaca: “Pela primeira vez podemos identificar novos locais de ligação mesmo sem ligantes conhecidos”.
Este avanço abre portas para a exploração de alvos terapêuticos órfãos e o desenvolvimento de estratégias para doenças complexas que antes eram difíceis de resolver. IsoDDE usa detecção automática de locais de interação molecular, ferramentas exclusivas como P2Rank para precisão e redução do tempo de sinal de semanas para segundos.
Quanto à previsão e otimização da combinação, os dados internos mostram isso O IsoDDE mantém alta correlação com resultados experimentais de seis principais famílias de proteínas e supera todos os métodos físicos e artificiais em benchmarks conhecidos da indústria..
A projeção de Laboratórios Isomórficos visa trazer medicamentos totalmente inteligentes para ensaios clínicos. Isto inclui alianças estratégicas Novartis sim Eli Lillyo que destaca a importância da indústria adquirida.
Segundo a equipe técnica da empresa, “o IsoDDE representa uma revolução nas ferramentas disponíveis para compreender e modificar a estrutura molecular do corpo humano,
